物流、貨運(yùn)公司的行業(yè)主管部門主要包括以下幾個(gè)方面：

1. 交通運(yùn)輸部門：如國家交通運(yùn)輸部、地方交通運(yùn)輸局等，負(fù)責(zé)對物流、貨運(yùn)行業(yè)的監(jiān)管和管理。

2. 工商行政管理部門：負(fù)責(zé)對企業(yè)的注冊、變更、注銷等手續(xù)進(jìn)行審批和監(jiān)管。

3. 稅務(wù)部門：負(fù)責(zé)對物流、貨運(yùn)企業(yè)的稅收政策進(jìn)行制定和執(zhí)行。

4. 質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督部門：負(fù)責(zé)對物流、貨運(yùn)企業(yè)的產(chǎn)品、服務(wù)質(zhì)量進(jìn)行監(jiān)督和檢查。

5. 環(huán)保部門：負(fù)責(zé)對物流、貨運(yùn)企業(yè)的環(huán)保設(shè)施和排放情況進(jìn)行監(jiān)管。

6. 安全生產(chǎn)監(jiān)管部門：負(fù)責(zé)對物流、貨運(yùn)企業(yè)的安全生產(chǎn)狀況進(jìn)行監(jiān)督檢查。

7. 行業(yè)協(xié)會：如中國物流與采購聯(lián)合會等，負(fù)責(zé)組織行業(yè)自律，推動行業(yè)發(fā)展。

8. 地方政府：地方政府在宏觀層面對物流、貨運(yùn)行業(yè)的發(fā)展進(jìn)行規(guī)劃和引導(dǎo)，同時(shí)在微觀層面對具體企業(yè)進(jìn)行管理和服務(wù)。