出疆棉運(yùn)費補(bǔ)貼的增值稅計算方法如下：

1. 確定出疆棉運(yùn)費補(bǔ)貼的金額。這通常由政府或相關(guān)部門根據(jù)棉花產(chǎn)量、市場價格等因素進(jìn)行測算，并給予企業(yè)一定的運(yùn)費補(bǔ)貼。

2. 計算增值稅應(yīng)納稅額。增值稅應(yīng)納稅額 = 出疆棉運(yùn)費補(bǔ)貼金額 × 增值稅稅率（一般為13%）。例如，如果增值稅稅率為13%，則增值稅應(yīng)納稅額 = $50000 \times 13\% = 6500$元。

3. 計算增值稅進(jìn)項稅額。增值稅進(jìn)項稅額 = 出疆棉運(yùn)費補(bǔ)貼金額 × 增值稅進(jìn)項稅率（一般為9%）。例如，如果增值稅進(jìn)項稅率為9%，則增值稅進(jìn)項稅額 = $50000 \times 9\% = 4500$元。

4. 計算增值稅應(yīng)交稅額。增值稅應(yīng)交稅額 = 增值稅應(yīng)納稅額 - 增值稅進(jìn)項稅額。例如，如果增值稅應(yīng)納稅額為6500元，增值稅進(jìn)項稅額為4500元，則增值稅應(yīng)交稅額 = $6500 - 4500 = 2000$元。

5. 將增值稅應(yīng)交稅額計入企業(yè)應(yīng)交稅費中。企業(yè)應(yīng)交稅費 = 增值稅應(yīng)交稅額 + 企業(yè)所得稅。例如，如果企業(yè)所得稅率為25%，則企業(yè)應(yīng)交稅費 = $2000 + 2000 \times 25\% = 4500$元。

出疆棉運(yùn)費補(bǔ)貼的增值稅計算方法為：先計算增值稅應(yīng)納稅額和增值稅進(jìn)項稅額，然后計算增值稅應(yīng)交稅額，最后將增值稅應(yīng)交稅額計入企業(yè)應(yīng)交稅費中。