(一)行業(yè)與政策的依存度過高早期跨境電商的產(chǎn)品種類相對較少，使得平臺受行業(yè)及政策影響較大，不利于跨境電商平臺的健康運營。

以青島為例，青島跨境電商海外貨源以韓國為主，其海運跨境電商直購進口的“第一單”即來自韓國。

但受“薩德事件”的影響，國內(nèi)消費韓國產(chǎn)品的需求下降，直接影響到青島跨境電商平臺的運營業(yè)績。

而政策影響最典型的事件莫過于三部委對跨境電商零售進口稅收政策的調(diào)整：2016年4月，財政部、海關(guān)總署、國家稅務總局決定實施跨境電商零售進口稅收政策，并同步調(diào)整行郵稅政策，極大影響了跨境電商園區(qū)實施的保稅進口模式，對各地跨境電商造成了很大沖擊。

(二)缺少嚴格的行業(yè)規(guī)范跨境電商自誕生之日起，假貨問題就困擾著跨境電商的發(fā)展，影響了跨境電商的形象。

假貨問題凸顯出跨境電商在行業(yè)規(guī)范方面的問題，如產(chǎn)品進口認證及全程追蹤系統(tǒng)的缺失。

目前，國內(nèi)的跨境電商多采取“保稅進口+海外直采”的模式，以保證產(chǎn)品來源的可靠性。

但是，“海外直采”存在很多問題，如在流轉(zhuǎn)過程中容易混入假貨，中小跨境電商平臺貨源混雜，有的甚至在招商渠道、商品流轉(zhuǎn)過程中鋌而走險。

(三)地方型平臺運營缺少競爭力由于政策紅利的刺激，跨境電商被稱為電子商務最后的“藍?！保舜罅康钠髽I(yè)進入。

除去原有的電商巨頭外，很多物流及快遞企業(yè)、傳統(tǒng)的商貿(mào)公司，甚至跨境電商園區(qū)等紛紛建立跨境電商平臺，積極投入運營。

但是，這些新建的平臺面臨著極大的運營問題。

一是存在著“重建設、輕運營”的誤區(qū)。

平臺系統(tǒng)開發(fā)難度大，很多跨境電商企業(yè)投入大量的資金，卻忽略了系統(tǒng)的運營，在運營人才儲備方面明顯不足。

二是缺少客戶積累，網(wǎng)站流量低。

平臺由于是新建立的平臺，獲客成本極高，網(wǎng)站活躍度不高。

三是產(chǎn)品結(jié)構(gòu)不合理，難以滿足消費者的全面購物需求。

由于很多跨境電商平臺的貨源具有明顯的地域特征，極大地影響了消費者的平臺使用率。

(四)物流和產(chǎn)業(yè)鏈亟待進一步完善跨境電商訂單多以零售為主，具有金額小、體積小、頻率高的特點，一般不采用集裝箱海運的傳統(tǒng)方式進行運輸，而采用國際小包和國際快遞，不能兼具運費低和速度快的優(yōu)點；B2C外貿(mào)企業(yè)集貨可以產(chǎn)生規(guī)模效益和降低運輸成本，但管理困難；第三方物流可以讓跨境電商平臺將主要精力放在主營業(yè)務上；海外倉儲模式可以有效提高速度，但成本較高。

(五)缺乏跨境電商專業(yè)人才跨境電商作為新興的對外貿(mào)易方式，涉及電子商務與國際貿(mào)易等多方面的知識，對從業(yè)人員有較高的要求。

由于教育部尚未設置跨境電商專業(yè)，人才匱乏成了各地跨境電商面臨的大問題之一。

據(jù)中國電子商務研究中心的數(shù)據(jù)顯示，目前，跨境電商企業(yè)多傾向于招聘國際貿(mào)易專業(yè)的人員(70.1%)；盡管國際貿(mào)易每年有大量的畢業(yè)生，但依然有85.9%的企業(yè)認為目前跨境電商人才存在缺口。

(六)信息化水平參差不齊地區(qū)間信息化程度的差異使得我國不同地區(qū)跨境電商發(fā)展出現(xiàn)了差異。

與廣州、上海等東部城市相比，中西部地區(qū)的信息化水平相對較低。

即使在跨境電商較為發(fā)達的地區(qū)，不同企業(yè)之間也存在著差異。

不同企業(yè)之間信息化水平的參差不齊容易造成企業(yè)信息化鏈條的斷裂。

而隨著各地跨境電商園區(qū)內(nèi)電商企業(yè)的日益增多，出人區(qū)產(chǎn)品的種類、倉儲、物流等各類信息流必須有強大的信息化平臺予以支撐。

信息化水平的低下，嚴重阻礙了全流程信息化系統(tǒng)的建設與推廣。