貨代公司代繳關(guān)稅是合法的。根據(jù)《中華人民共和國海關(guān)法》和《中華人民共和國進(jìn)出口關(guān)稅條例》，進(jìn)出口貨物的收貨人、發(fā)貨人或者的代理人可以委托貨代公司代為辦理報關(guān)、納稅等手續(xù)。貨代公司代繳關(guān)稅是指貨代公司作為收貨人或發(fā)貨人的代理人，在貨物進(jìn)出口時，代表收貨人或發(fā)貨人向海關(guān)申報并繳納關(guān)稅。這是為了簡化手續(xù)，提高效率，減輕企業(yè)負(fù)擔(dān)。

但是，需要注意的是，貨代公司在代繳關(guān)稅時，必須遵守相關(guān)法律法規(guī)，確保所代繳的關(guān)稅金額準(zhǔn)確無誤。同時，貨代公司還需要與收貨人或發(fā)貨人簽訂代理協(xié)議，明確雙方的權(quán)利和義務(wù)。如果貨代公司違反規(guī)定，導(dǎo)致關(guān)稅錯誤或不合規(guī)，可能會面臨法律責(zé)任。