技術(shù)壁壘：產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈的自主可控需要掌握核心技術(shù)，但目前很多關(guān)鍵技術(shù)仍然被外國企業(yè)所控制。

資金投入大：建立自主可控的產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈需要大量的資金投入，包括研發(fā)、設(shè)備購置、人才培養(yǎng)等，這對許多中小企業(yè)來說是一個巨大的挑戰(zhàn)。

人才短缺：掌握核心技術(shù)需要高素質(zhì)的人才，但目前我國在相關(guān)領(lǐng)域的人才儲備不足，難以滿足產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求。

政策支持不足：雖然國家已經(jīng)出臺了一系列政策來支持產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈的自主可控，但在實際操作中，政策執(zhí)行力度和效果仍有待提高。

國際合作與競爭：在全球化的背景下，產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈的自主可控需要在國際合作與競爭中尋求平衡，這需要政府和企業(yè)共同努力。

市場準(zhǔn)入限制：在某些領(lǐng)域，由于市場準(zhǔn)入限制，企業(yè)難以進入或擴大市場份額，這也影響了產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈的自主可控。

知識產(chǎn)權(quán)保護：在全球化的背景下，知識產(chǎn)權(quán)的保護尤為重要，但目前我國在這方面還存在一些問題，如侵權(quán)、盜版等，這些都影響了產(chǎn)業(yè)鏈供應(yīng)鏈的自主可控。