工程項目稅負率是指工程項目在運營過程中需要繳納的各種稅費與項目總成本的比例。計算方法如下：

1. 需要計算出項目的總成本。這包括了項目的直接成本（如人工費、材料費等）和間接成本（如管理費、折舊費等）。

2. 然后，需要計算出項目需要繳納的各種稅費。這包括了增值稅、企業(yè)所得稅、印花稅、土地使用稅等。

3. 最后，將項目需要繳納的稅費除以項目總成本，得到項目的稅負率。

例如，假設一個工程項目的總成本為100萬元，需要繳納的增值稅為8萬元，企業(yè)所得稅為5萬元，印花稅為2萬元，土地使用稅為1萬元。那么，該項目的稅負率為：(8 + 5 + 2 + 1) / 100 = 16%。

這個例子中，項目的總成本是100萬元，需要繳納的稅費總額是20萬元，所以稅負率是20/100=20%。