此種模式需要中國人民銀行指定境外某銀行(一般為境外分行)為人民幣境外清算行，由境外清算行與境外商業(yè)銀行簽訂人民幣代理結算協(xié)議，并為其開立人民幣同業(yè)往來賬戶，代理境外銀行進行人民幣跨境收付等服務。

例如，業(yè)務場景是境外企業(yè)A需要支付資金給境內企業(yè)B。

前置工作有A在境外花旗銀行開設結算賬戶，B在境內農(nóng)業(yè)銀行開設結算賬戶;中國人民銀行指定中國銀行某境外分行(商業(yè)銀行)為該地區(qū)的人民幣清算行;花旗銀行在中國銀行境外分行開設人民幣同業(yè)往來賬戶，存入資金;花旗銀行和中國銀行境外分行通過SWIFT 或當?shù)氐慕Y算系統(tǒng)連接;中國銀行境外分行與中國銀行境內總行之間通過行內連接系統(tǒng)連接，中國銀行境內總行與境內農(nóng)業(yè)銀行通過CNAPS連接。

清算行模式和第一種代理行模式在收付款兩方體驗上的區(qū)別不大，核心在于資金的結算地不同。

采用代理行模式的前提是，境內的銀行具備國際結算業(yè)務能力。

其主要通過SWIFT 與境外銀行連接，當境外銀行和境內代理銀行進行結算時，此筆資金為國際結算(境外結算)。

而采用清算行模式的前提是，境內銀行在境外的分行被中國人民銀行指定為境外人民幣清算銀行。

這樣其與境外銀行可以“能力共享”，資金的結算在清算行的內部系統(tǒng)中進行。

如上述例子，資金是在中國銀行行內完成結算的(境外分行和境內總行之間)。