1.部門之間的信息共享和交換不暢報(bào)關(guān)部門實(shí)際是一個“窗口”，企業(yè)的信息由此報(bào)送到政府部門。

報(bào)關(guān)部門自身不會產(chǎn)生信息，只有從其他部門或者公司內(nèi)部管理系統(tǒng)中獲取相關(guān)的信息。

如果報(bào)關(guān)部門不能從其他部門及時獲得準(zhǔn)確的信息，或者不能從企業(yè)資源計(jì)劃(Enterprise Resource Planning，ERP)系統(tǒng)中獲得相應(yīng)授權(quán)去獲取信息，其申報(bào)的數(shù)據(jù)就會失真。

另一方面，如果采購、銷售、物流部門不能從報(bào)關(guān)部門獲得海關(guān)和其他政府部門的申報(bào)要求，則可能因資料準(zhǔn)備不充分而最終導(dǎo)致裝船延誤、收貨或者發(fā)貨延遲。

其他部門對海關(guān)監(jiān)管要求不清楚，會導(dǎo)致公司內(nèi)部海關(guān)監(jiān)管貨物的管理不能符合海關(guān)的監(jiān)管要求，如擅自處理減免稅設(shè)備和保稅貨物等。

2.報(bào)關(guān)部門內(nèi)部控制混亂報(bào)關(guān)部門內(nèi)部不同人員職能沒有分離，缺乏有效的授權(quán)管理制度，其結(jié)果就是某些關(guān)務(wù)人員的權(quán)力過大且失去控制。

當(dāng)然，站在關(guān)務(wù)人員的角度來看，混亂的內(nèi)部控制制度會使得關(guān)務(wù)人員覺得沒有有效后備支持，工作積極性自然備受打擊。

報(bào)關(guān)部門內(nèi)部對報(bào)關(guān)人員的考評和考核沒有依據(jù)，管理層也只問“結(jié)果”不管“過程”，只要求報(bào)關(guān)順利、核銷順利，降低納稅成本。

在這種考核模式下，將關(guān)務(wù)人員的職責(zé)由“如實(shí)申報(bào)”轉(zhuǎn)變?yōu)椤笆《惐芏悺保渫鶗苤鼐洼p，粉飾風(fēng)險，深埋“地雷”，只考慮當(dāng)前的利益而忽視長遠(yuǎn)風(fēng)險控制。

3.單證資料和報(bào)表的管理不完善報(bào)關(guān)部門的報(bào)關(guān)單證往往是其他部門的重要憑證，如報(bào)關(guān)單是辦理出口退稅和外匯核銷的關(guān)鍵憑證。

有些企業(yè)沒有建立有效的單證流轉(zhuǎn)和交接流程，報(bào)關(guān)單證往往會在流轉(zhuǎn)中丟失，或者滯壓單證超過有效期限，致使無法辦理稅務(wù)和外匯手續(xù)，造成不應(yīng)有的損失。

例如，有些企業(yè)報(bào)關(guān)人員離職后，企業(yè)才發(fā)現(xiàn)一批進(jìn)口報(bào)關(guān)單“失蹤”了，致使外匯一直無法支付。

有些企業(yè)報(bào)關(guān)部門沒有建立內(nèi)部作業(yè)臺賬、內(nèi)部管理報(bào)表，管理層無法及時了解關(guān)務(wù)的執(zhí)行情況，也無法判斷關(guān)務(wù)方面存在的問題和合規(guī)性風(fēng)險。

4.關(guān)務(wù)方面的內(nèi)部復(fù)核和內(nèi)部審計(jì)制度不完善有些企業(yè)對申報(bào)過程缺乏有效的復(fù)核制度。

許多企業(yè)關(guān)務(wù)人員之間的分工都是每個人從事不同領(lǐng)域的報(bào)關(guān)，相互之間沒有交叉復(fù)核。

這樣許多差錯和遺漏都無法及時發(fā)現(xiàn)，只能依賴報(bào)關(guān)企業(yè)的報(bào)關(guān)人員來復(fù)核發(fā)現(xiàn)，但報(bào)關(guān)企業(yè)的報(bào)關(guān)人員每天要處理的單證非常多，對企業(yè)的商品和交易不如本企業(yè)的工作人員熟悉，因此，錯誤和遺漏經(jīng)常不能被及時發(fā)現(xiàn)。

大多數(shù)企業(yè)都有內(nèi)部審計(jì)和外部審計(jì)制度，但是這些審計(jì)大多覆蓋一些常規(guī)的財(cái)務(wù)、會計(jì)和其他業(yè)務(wù)。

國內(nèi)企業(yè)的內(nèi)部審計(jì)制度有兩個來源：一是沿襲原有國有企業(yè)的內(nèi)部審計(jì)制度；二是沿用外國跨國公司的內(nèi)部審計(jì)制度。

這兩個內(nèi)部審計(jì)制度，前者會忽視關(guān)務(wù)方面的審計(jì)，而后者無法適用于國內(nèi)關(guān)務(wù)的復(fù)雜性。