跨境電商中不同的貿(mào)易方式，存在的問題有一定的差異，按一般貿(mào)易方式進出口的大額交易，目前尚未完全實現(xiàn)貿(mào)易的無紙化，這在一定程度上影響了貿(mào)易的便利化及電子商務(wù)在貿(mào)易中的應(yīng)用。

從小額碎片化的貿(mào)易來看，除受到未實現(xiàn)的貿(mào)易無紙化影響外，在產(chǎn)品、物流、通關(guān)等方面也存在一些行業(yè)性的難題，這些成為制約跨境電商發(fā)展的重要因素。

產(chǎn)品同質(zhì)化嚴重:近年來跨境電商發(fā)展迅速，吸引了大量商家的涌入，行業(yè)競爭加劇。

一些熱銷且利潤空間較大的產(chǎn)品如3C產(chǎn)品及附件等，眾多跨境電商公司都在銷售，產(chǎn)品同質(zhì)化現(xiàn)象嚴重，行業(yè)內(nèi)甚至出現(xiàn)惡劣的價格戰(zhàn)。

品牌化未建立:跨境電商發(fā)展起來很大程度上是源于中國制造大國的優(yōu)勢，以價格低廉的產(chǎn)品吸引消費者,目前跨境電商行業(yè)很多產(chǎn)品是從一些小工廠出貨,包括一些3C、服裝等,整個產(chǎn)品質(zhì)量控制相對來說還有一定的問題，大部分跨境電商企業(yè)還未涉及品牌化建設(shè)階段。

物流時間長且浮動范圍大:跨境電商由于涉及跨境較復(fù)雜且各國間政策差異較大，很難像內(nèi)貿(mào)電商一樣通過自建物流的方式來解決跨境電商的物流問題。

跨境電商的物流，物流周期非常長，到美國和歐洲一般要7~15天，到南美、巴西、俄羅斯更長(25~35天)，除物流時間長之外，物流還存在時效投遞不穩(wěn)定的問題，收貨時間波動很大，有時7天收到，有時20天收到。

通關(guān)結(jié)匯難:隨著跨境貿(mào)易逐漸向小批量碎片化發(fā)展，除B2C外，小額貿(mào)易B2B企業(yè)同樣面臨通關(guān)的問題。

由于小額B2B和B2C跨境貿(mào)易電子商務(wù)與一般出口貿(mào)易有差異，在出口過程中存在難以快速通關(guān)、規(guī)范結(jié)匯、享受退稅等問題，雖然目前國家針對跨境電商零售出口提出可“清單核放、匯總申報”的通關(guān)模式，但該政策僅針對B2C企業(yè)，大量從事小額B2B的外貿(mào)中小企業(yè)仍存在通關(guān)困難的問題。

在進口過程中，存在以非法進口渠道逃避海關(guān)監(jiān)管，以及進口商品品質(zhì)難以鑒別、消費者權(quán)益得不到保障等問題。

跨境電商人才缺失:跨境電子商務(wù)貿(mào)易在快速發(fā)展的同時，逐漸暴露出綜合型外貿(mào)人才缺口嚴重等問題。

跨境電商人才缺失主要是因為:(1)語種限制。

目前做跨境電商的人才主要還是來自外貿(mào)行業(yè)，但英語專業(yè)居多，一些小語種電商人才缺乏，但事實上，像巴西、印度、俄羅斯、阿拉伯、蒙古等國家，跨境電商具有很大的發(fā)展?jié)摿?，也是跨境電商企業(yè)關(guān)注的重點。

(2)能力要求高。

從事跨境電商業(yè)務(wù)的人才，除語種的限制外，還要能了解國外的市場、交易方式、消費習(xí)慣等。

此外，還要了解各大平臺的交易規(guī)則和交易特征。

基于這兩個特點，符合跨境電商要求的人才很少，跨境電商人才缺乏已經(jīng)成為業(yè)內(nèi)常態(tài)。