生物識別有其自己的特點，在具體的生物類別上還會產(chǎn)生不同特性，這些特性往往存在著一些準確性方面的障礙，因此，生物識別系統(tǒng)以及生物識別技術(shù)在某種程度上也會具有一定的局限性。

①信息的局限性（information limitation）。

每種生物特征只能夠表達一定量的信息，這些信息往往可以通過指紋技術(shù)來進行獲取。

②特征描述的局限性（representation limitation）。

最為根本和最為理想的信息技術(shù)涵蓋了許多區(qū)間信息，這些區(qū)間信息能夠完整表達一些信息量，如果信息量判斷出現(xiàn)錯誤，就會產(chǎn)生一些根本性的問題。

③缺乏恒定性（invariance limitation）。

最為理想的配置應(yīng)該能夠適應(yīng)多種模式發(fā)展，但在實際的配置過程當(dāng)中往往會因為無法適應(yīng)新的訓(xùn)練模式，而導(dǎo)致各種錯誤的存在和產(chǎn)生。